Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTA2P62736 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms