Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF3P61204 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF3P61204 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF3P61204 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF3P61204 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF3P61204 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF3P61204 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF3P61204 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms