Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms