Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO3P55854 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms