Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNU13P55769 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNU13P55769 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNU13P55769 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms