Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms