Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DAP3P51398 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
DAP3P51398 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DAP3P51398 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DAP3P51398 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DAP3P51398 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms