Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK8P49336 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK8P49336 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms