Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF5P43026 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF5P43026 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GDF5P43026 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GDF5P43026 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF5P43026 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF5P43026 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms