Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms