Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLT4P35916 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLT4P35916 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLT4P35916 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLT4P35916 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLT4P35916 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLT4P35916 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLT4P35916 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLT4P35916 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLT4P35916 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLT4P35916 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLT4P35916 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLT4P35916 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLT4P35916 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLT4P35916 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLT4P35916 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLT4P35916 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms