Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms