Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD1P28340 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD1P28340 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD1P28340 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD1P28340 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms