Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms