Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms