Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XPAP23025 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XPAP23025 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XPAP23025 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XPAP23025 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XPAP23025 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms