Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6A1P12074 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms