Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms