Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI3P10071 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI3P10071 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI3P10071 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GLI3P10071 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms