Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIMD1P0DJR0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms