Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms