Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PKHD1P08F94 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PKHD1P08F94 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PKHD1P08F94 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
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PKHD1P08F94 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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