Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLK3P07288 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLK3P07288 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLK3P07288 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLK3P07288 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLK3P07288 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLK3P07288 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLK3P07288 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLK3P07288 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLK3P07288 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLK3P07288 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms