Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms