Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CBX7O95931 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CBX7O95931 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX7O95931 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX7O95931 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX7O95931 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms