Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms