Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIN3BO75182 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms