Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY75O60449 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LY75O60449 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LY75O60449 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY75O60449 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY75O60449 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY75O60449 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY75O60449 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms