Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms