Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMBP2O15034 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms