Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms