Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms