Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIP1O00291 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIP1O00291 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms