Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms