Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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LINC00587B1AMM8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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LINC00587B1AMM8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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LINC00587B1AMM8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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LINC00587B1AMM8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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LINC00587B1AMM8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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LINC00587B1AMM8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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LINC00587B1AMM8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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