Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIPT2A6NK58 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms