Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEMA6NI47 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEMA6NI47 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms