Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms