Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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