Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 516.7 ms