Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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NECTIN1Q15223 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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NECTIN1Q15223 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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NECTIN1Q15223 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NECTIN1Q15223 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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