Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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NME3Q13232 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NME3Q13232 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NME3Q13232 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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