Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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