Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NKX1-1Q15270 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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