Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms