Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPREP23469 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPREP23469 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPREP23469 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPREP23469 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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