Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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