Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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