Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms