Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM32Q13049 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms